Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTF2Q9UNY4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTF2Q9UNY4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTF2Q9UNY4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms