Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ0

STRIP2, Striatin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP2Q9ULQ0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRIP2Q9ULQ0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRIP2Q9ULQ0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRIP2Q9ULQ0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRIP2Q9ULQ0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP2Q9ULQ0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP2Q9ULQ0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP2Q9ULQ0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRIP2Q9ULQ0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms