Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGA1Q9UJY5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GGA1Q9UJY5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms