Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIX4Q9UIU6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms