Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLCO3A1Q9UIG8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO3A1Q9UIG8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO3A1Q9UIG8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO3A1Q9UIG8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO3A1Q9UIG8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO3A1Q9UIG8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO3A1Q9UIG8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO3A1Q9UIG8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLCO3A1Q9UIG8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms