Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
IFT172Q9UG01 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms