Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM10Q9UDY6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM10Q9UDY6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms