Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL9Q9P2J3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms