Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms