Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RRN3Q9NYV6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRN3Q9NYV6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
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