Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLHL28Q9NXS3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLHL28Q9NXS3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms