Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDAP2Q9NXN4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms