Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRMT1Q9NXH9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT1Q9NXH9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms