Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RHBDL2Q9NX52 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms