Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TMEM140Q9NV12 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms