Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GINM1Q9NU53 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINM1Q9NU53 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms