Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB4Q9NTQ9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB4Q9NTQ9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms