Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDREJQ9NTG1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDREJQ9NTG1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDREJQ9NTG1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDREJQ9NTG1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDREJQ9NTG1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDREJQ9NTG1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDREJQ9NTG1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDREJQ9NTG1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDREJQ9NTG1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKDREJQ9NTG1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms