Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMSN1Q9NSI8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms