Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT84Q9NSB2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT84Q9NSB2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms