Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMCO4Q9NRQ5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms