Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf4Q9NR00 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C8orf4Q9NR00 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C8orf4Q9NR00 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C8orf4Q9NR00 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C8orf4Q9NR00 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C8orf4Q9NR00 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C8orf4Q9NR00 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C8orf4Q9NR00 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms