Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms