Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1Q9HCU9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRMS1Q9HCU9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms