Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VAT1LQ9HCJ6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms