Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCAS3Q9H6U6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms