Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms