Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PACSIN1Q9BY11 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PACSIN1Q9BY11 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms