Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SNHG12Q9BXW3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNHG12Q9BXW3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNHG12Q9BXW3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNHG12Q9BXW3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNHG12Q9BXW3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNHG12Q9BXW3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNHG12Q9BXW3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNHG12Q9BXW3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNHG12Q9BXW3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNHG12Q9BXW3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNHG12Q9BXW3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNHG12Q9BXW3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNHG12Q9BXW3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNHG12Q9BXW3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNHG12Q9BXW3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNHG12Q9BXW3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNHG12Q9BXW3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNHG12Q9BXW3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNHG12Q9BXW3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNHG12Q9BXW3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNHG12Q9BXW3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms