Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
RNF17Q9BXT8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RNF17Q9BXT8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RNF17Q9BXT8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms