Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ3

C1QTNF4, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF4Q9BXJ3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1QTNF4Q9BXJ3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms