Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRNP25Q9BV90 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNRNP25Q9BV90 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNRNP25Q9BV90 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNRNP25Q9BV90 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNRNP25Q9BV90 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRNP25Q9BV90 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRNP25Q9BV90 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms