Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFAF3Q9BU61 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms