Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT17Q9BSW7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT17Q9BSW7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms