Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRACR2AQ9BSW2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms