Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIOK1Q9BRS2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIOK1Q9BRS2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms