Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC77Q9BR77 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms