Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOXF2Q9BQY4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOXF2Q9BQY4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms