Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM4BQ9BQ04 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms