Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UHRF1Q96T88 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms