Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHF12Q96QT6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF12Q96QT6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms