Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRNT1Q96Q11 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRNT1Q96Q11 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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