Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMTK3Q96Q04 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms