Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNGAP1Q96PV0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNGAP1Q96PV0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms