Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL3

ZNF599, Zinc finger protein 599, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF599Q96NL3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF599Q96NL3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF599Q96NL3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF599Q96NL3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF599Q96NL3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF599Q96NL3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF599Q96NL3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF599Q96NL3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF599Q96NL3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms