Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDHR1Q96JP9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms