Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CELF6Q96J87 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms