Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms