Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM46AQ96IP4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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FAM46AQ96IP4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
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FAM46AQ96IP4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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FAM46AQ96IP4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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FAM46AQ96IP4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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FAM46AQ96IP4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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FAM46AQ96IP4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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FAM46AQ96IP4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM46AQ96IP4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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