Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APIPQ96GX9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APIPQ96GX9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms